В новом сезоне Иван Прохоров, он же — Зверобой, переезжает в Москву, куда его переводят по службе. В столице его опыт используется более широко, а дар приобретает новую мощь, ведь теперь Зверобой — сотрудник спецотдела, занимающегося раскрытием преступлений особой сложности, которые могут нанести серьезный ущерб безопасности страны. Сериал Зверобой 3 сезон

Руководство отдела считает Ивана уникальным сотрудником. Его подключают к операции по выявлению сети наркодилеров и задержанию членов преступной организации, к расследованию дела о взрыве на железной дороге и крушении поезда, к поиску причин загадочной гибели известной модели и к распутыванию хитроумных интриг дельцов от медицины. Также благодаря Зверобою удается предотвратить попытку продажи за рубеж новейшей научной разработки, оцениваемой как достояние страны.